瑶医看病主要是审病求因，它的基本理论是盈亏平衡理论。这一理论提示了机体是个统一的整体，它不但要求机体自身各脏腑之间的盈亏平衡，亦要求机体与周围环境相互平衡。根据这一理论的内涵，瑶医疾病分类与命名为盈则满，满则溢，溢则病，如脑溢血、血山崩等症。同样，亏则虚，虚则损，损则病，如眩晕，贫血，哮喘等症，这些症候大都由于某些方面的亏虚引起的。又如冬春天气久雨不晴，气候潮湿，这时瑶医审症常见人们有“湿气重”的表现，即是湿盈，湿盈就会引起寒湿凝滞，寒湿凝滞常引起风湿病，故在岭南冬春季风湿病为多发病。

瑶医在对疾病的分类上，根据疾病发生的部位、形象、症状、缓急等情况进行以病分科，以科分症，以症分疾。将所有疾病归纳为内、外、妇、儿、五官、瘟疫六科，四十七症 ，一百八十八疾。即内科一十五症，六十六疾；外科，六症，六十三疾；妇科，五症，一十五疾；儿科五症，一十五疾；五官科，一十症，一十五疾；瘟疫科，六症，一十七疾。病名的称呼是按疾病发生部位，体形、色泽等生动描述而定名。如感冒病欲沤，舌根部静脉膨起，称“蚂蝗痧”。外科，疔、痈等，生于指头，称“蛇头疔”，生于指中段，称“鱼肚痧”。痈生背部溃烂坏死者，称“背花”、“望月疳”。小儿惊风：两手抽搐，称“鸡爪风”，两足弯曲卷缩，称“蛇卷风”；口吐白沫者，称“猪婆风”。

瑶族人民对医药的认识过程和其他少数民族一样，是从以迷信鬼神开始到医药鬼神共存即巫医结合，进而到医药占主导地位的发展过程。即是由形成雏形信仰疗法、医巫结合到形成体系的经验医药及实验医药的逐步发展过程。