藏族人民早在远古时代时就开始用开水治疗消化不良等医疗实践活动，据敦煌本吐蕃医学文献记载：“患蛾喉头痛者用牛角、岩羊角、山羊角、马蹄等调外合剂”，这是古代藏族人民发现动植物的药用价值的有力证明。此外，藏族人民对外伤的处理由开始用“泥土、酥油、酒糟来外敷伤口”。逐渐地总结出一些敷治外伤的方法。由于发现使用烧热的石块和砂土贴附于身体的某些部位有止痛的功效，于是便产生了热敷和火灸。可以说藏族医学发源于藏区各族人民的医疗实践。公元前5、6世纪出现了一位杰出的藏医学家协普赤西。据笨教史记载：“协普赤西是笨教师祖辛挠的长子”，曾任王室侍医。他收集民间的医疗经验著成《医学九法》、《疗法月光》等，总结了藏医学的实践经验。此后涌现了许多藏医学家。但是由于当时的人们不可能完全理解各种自然现象，相信超自然力是疾病的原因，因此便出现了笨教巫术和藏医学并存的局面。然而，如果由此认为藏医产生于笨教，则是完全违背历史事实的。

公元641年文成公主进藏，加强了藏汉民族间的特殊关系，促进了吐蕃社会的进一步发展和繁荣。据《西藏王统记》记载，文成公主进藏时带来了"医方百种，诊法五种，医械六种，论著四本"，可以推断这些医书对藏