蒙古族原居于我国北方额尔古纳河密林深处，属于东胡民族系统。七世纪时，我国北方少数民族受唐朝中央政府管辖。其后，辽、金建国，蒙古族在北方曾不断和两国战争。至十二世纪时，蒙古族在成吉思汗(铁木真，1162—1227)领导下，日益强大，于1206年建立蒙古汗国，先后三次大举西征，所到达于中亚、欧洲东部。蒙古族文化原来不很发达，元朝建立以后，极力吸收外族文化。在医药方面，对汉族医药、阿拉伯医药，以及道教养生理论开始重视。以后随着元朝的灭亡，这些吸收外族医药文化的传统，又逐渐消弱。

蒙古族医学的形成，据一般说法，它是十六世纪下半叶开始的 ......蒙医基本理论蒙医以“赫依”、“希拉”、“巴达干”三根的关系来解释人体的生理、病理现象。所谓“赫依”，是指各种生理功能的动力。凡是思维、语言、动作及各脏器的功能活动，都受它支配。如果“赫依”功能失常，则会导致脏腑功能减弱，表现为神志异常、失眠、健忘等。“希拉”有火热之意。